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(1)无害，保证安全卫生。有些芽苗中存在对人体有害物质，实用家庭阳台芽苗菜设备，必须重视。比如马铃挤的芽因含有龙葵素，会损伤人体神经，不得食用;棉籽中含有棉籽酚，不能作为芽苗菜品种;对大多数中国人来说，不失为“美味”的蚕豆芽，却因有些人食用蚕豆芽和蚕豆苗 (包括食用蚕豆)时，会出现体衰、疲乏、苍白、黄疸以及血红蛋白尿等症状。这就是习惯上及说的“蚕豆病”。因而初次食用蚕豆芽时，一定要少食，又如:花生芽味美香甜，但不良的花生种子，极易污染菌类，不能用来生成花生芽。因而，选择优良种子至关重要。当然也不能忽视种植方法。
(2）营养丰富。在充分了解芽苗菜品种药理性能的基础上，进行选择。
(3)口感好，独其风味。要选择适于当地或个人口味的品种。如碗豆苗清爽宜人，萝卜苗爽口辛辣，香椿芽芳香浓郁，苜蓿芽提神清口，黄芥芽辛辣刺激等。